Ngày nay, chi phí sản xuất hydro xanh vẫn còn cao. Trong một báo cáo được công bố vào năm ngoái (sử dụng dữ liệu 2 0 18), Cơ quan Năng lượng Quốc tế đặt chi phí hydro xanh ở mức 3 đô la đến 7,5 đô la cho mỗi kg, trong khi chi phí sản xuất hydro được trang bị thêm khí mêtan là 0,90 đô la đến 3,20 đô la cho mỗi ki-lô-gam. Giảm giá thành của máy điện phân là rất quan trọng để giảm giá hydro xanh, nhưng nó sẽ mất thời gian và quy mô. Cơ quan Năng lượng Quốc tế cho biết năm ngoái rằng chi phí máy điện phân có thể giảm một nửa vào năm 2040 từ khoảng 840 USD / kilowatt công suất hiện nay. Trường hợp kinh doanh đối với hydro xanh cần rất nhiều điện tái tạo giá rẻ, vì một phần đáng kể của quá trình điện phân bị mất. Bộ điện phân có hiệu suất từ 60% đến 80%, theo Shell.
Nhiều ứng dụng có thể yêu cầu hydro xanh để cung cấp năng lượng cho pin nhiên liệu, dẫn đến tổn thất hơn nữa khiến thách thức về hiệu suất thậm chí còn nghiêm trọng hơn. Một số nhà quan sát suy đoán rằng sản xuất hydro xanh có thể hấp thụ công suất năng lượng tái tạo dư thừa ở các trung tâm sản xuất lớn như các trang trại gió ngoài khơi của châu Âu. Tuy nhiên, do chi phí của các máy điện phân vẫn còn cao, nên liệu các nhà phát triển các dự án hydro xanh có sẵn sàng để các máy điện phân của họ không hoạt động cho đến khi giá năng lượng tái tạo giảm xuống một mức nhất định hay không. Nhiều khả năng, khi BP và Shell đang xem xét, các nhà phát triển sẽ xây dựng các nhà máy sản xuất hydro xanh ở các khu vực giàu tài nguyên và trang bị cho chúng các tài sản phát điện tái tạo chuyên dụng.
